父の意思とは違う文章の公正証書遺言案を出してきました

お父様自身がしっかりしているということであれば、解任の意思表示はお父様自身で行なう必要があります。
口頭でお話ししても言いくるめられてしまうとのことですので、お父様直筆で解任する旨の文書を作成し、原本郵送、写しをＦＡＸで送付するとよいでしょう。
仮に強引に公正証書作成手続の段階まで行っても、公証人がお父様の意思確認を行なうので、その時に同意しない旨お父様が述べれば、おそらく上記内容での更生諸所遺言の作成は認められないと思われます。

遺言の効力に関しては、最後に作成されたものが有効であり、それ以前の遺言は無効となります。公正証書遺言が作成された場合であっても、後で自筆証書遺言が作成された場合には後者が有効になります。

今後の対策としては、①取り急ぎ、全文自筆で日付記入及び署名押印の上で自筆証書遺言を作成頂いた上、②最寄りの弁護士会等に相談して中立的立場の弁護士を紹介して頂き、同様の内容の公正証書遺言を作成する、といった方法が考えられます。

現在の対策は、小川先生の回答のとおりです。
お父様が90歳以上で高齢と言うことです。失礼ながら、今後認知症等意思判断が出来なくなった際は、財産の管理や相続時に争いにならぬよう、成年後見制度を利用されてはいかがでしょうか
お話を聞く限り、将来相続人間で争相続に発展することも考えられそうです。
家庭裁判所で中立的な弁護士を成年後見人に選任してもらえば、財産の使い込みや次女と父との間で知らぬ間に契約をすることを防ぐなどの対策になるでしょう。
今後の対策の１つとして覚えておいて頂ければと思います
手続きに困ったら弁護士に依頼して下さい