足並みが揃っていないが、大丈夫か？

合同会社（居酒屋）の経営の問題はありますが、ご相談者様のご主人が相続放棄を予定されているのであれば、何も手を付けないのが無難でしょう。
厳密に法人財産の帰属がどうなるかはともかく、お義父様の相続財産の処分行為を行なった場合、法定単純承認として相続放棄が認められなくなるおそれがあります（民法921条1号本文）。
居酒屋の経営の承継を予定されている方は承継後の経営継続に向けた対応を行なう必要がありますが、兄弟姉妹で見解が異なるのであれば、速やかに相続放棄を行ない、相続人を確定させる必要があるでしょう。