長男の相続分

（１）ご指摘の通り、お母様の収入がお父様の預金口座に入金されていた場合、お母様からの預かり金と解するかお父様に対する寄与分と解するかはともかく、お母様からの入金分はお父様の相続財産から控除し、残額を具体的な分割対象とするのが妥当ではないかと思います。
ただし、現実にお母様から入金がなされていたか、なされていたとしていくらなのかについては、入金記録やお母様の収入に関する記録等から明らかにする必要があります。
（２）お母様が亡くなったときにお父様の分もまとめて分割することは、現在の相続人全員が合意していれば可能です。
しかし、お兄様が速やかにお父様の遺産分割を実施したいということであれば、法的には拒否することは難しいです。
また、御母様の相続分相当額はお母様の財産となりますので、厳密にはお母様が亡くなられたときの遺産総額についてお母様の相続に関する遺産分割として実施することになると思われます。相続人全員が合意すれば、異なる内容での遺産分割も可能です。