妹からの請求

詳細なご事情を伺わないと明確なご回答はできませんが、上記のご事情の限りでは、妹さんの主張は争う必要があるでしょう。
まず、①土地の無償使用については、原則として特別受益に当たりますが、市場の賃料相当額ではなく、使用借権相当額（通常、更地価格の１～３割程度）とされます。
次に、②お父様の生活費については、現実にお父様の生活費として使用したのであれば、精算の必要はありません。ただし、支出の内容や根拠資料は明らかにする必要があるでしょう。
③貴殿の休業補償相当額は、看護に専念する対価であり、従前の収入に照らし相当額であれば特別受益には当たらないでしょう。
④建物新築時の贈与５００万円は特別受益に該当しますが、上記請求額に照らせば、精算が必要か疑義があります。
法的に複雑になると見込まれるため、弁護士依頼を含め検討頂いた方がよいかと思います。

土地の使用料については、相手の主張通りは支払わなくてよいでしょう。
父親の生活費の弁済は不要です。
大口の出費はともかく、日常の出費おおよその収支を主張すればよいです。